Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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