Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms