Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms