Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP13P45452 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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