Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF1P21675 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TAF1P21675 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF1P21675 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF1P21675 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF1P21675 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms