Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms