Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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