Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PKHD1P08F94 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
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