Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms