Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms