Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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ARL2-SNX15V9GYD0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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