Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms