Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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