Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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