Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHPF2Q9P2E5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms