Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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