Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM7Q9BQ49 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms