Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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