Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms