Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms