Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLCB2Q00722 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLCB2Q00722 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLCB2Q00722 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLCB2Q00722 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLCB2Q00722 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLCB2Q00722 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLCB2Q00722 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLCB2Q00722 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms