Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSBP2P81877 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms