Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms