Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms