Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
UBE2D1P51668 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms