Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCA2P51531 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms