Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK8P49336 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK8P49336 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK8P49336 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms