Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CXCR5P32302 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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