Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTGFP29279 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTGFP29279 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms