Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTPRMP28827 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTPRMP28827 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRMP28827 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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