Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD1P28340 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms