Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT13P13646 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT13P13646 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT13P13646 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT13P13646 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms