Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms