Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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