Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms