Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms