Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms