Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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