Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms