Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HDAC6Q9UBN7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC6Q9UBN7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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