Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CNTN3Q9P232 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CNTN3Q9P232 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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CNTN3Q9P232 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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