Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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