Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUSC1Q9BVN2 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms