Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
MCMBPQ9BTE3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms