Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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