Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC12Q8WUD4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms