Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RTL8BQ17RB0 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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