Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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