Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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