Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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